Ve voze Touareg bude vždy příjemné klima. Zajistí to klimatizace Climatronic s regulací teploty ve dvou, resp. na přání ve čtyřech zónách. Řidič i spolujezdec a volitelně také cestující na zadních místech si mohou nezávisle na sobě regulovat nastavení ve své klimatizační zóně. Radovat se mohou i alergici trpící sennou rýmou, protože antialergenní filtr zbavuje čerstvý vzduch přiváděný do interiéru pylových zrn.

Klimatizace navíc brání pronikání nepříjemných pachů do interiéru vozu, protože automaticky přepíná na vnitřní cirkulaci v případě, že dojde k aktivaci ostřikovačů čelního skla nebo k zařazení zpátečky. Regulace závislá na rychlosti jízdy pak řídí otáčky ventilátoru tak, aby se při pomalejší jízdě snížila hladina hluku v kabině.